الفرق من حيث جدار الخلية :
الخلية البكترية جدارها بيتكون من البولى بيبتيد بروتين فى الاساس اما الفطريات الجدار الخلوى بتاعها بيتكون من السليلوز و ممكن بعض المواد الاخرى تشترك مع السليلوز فى التكوين زى البكتين
الفرق فى المادة الوراثية : الخلية البكتيرية لا تحتوى على نواة حقيقية ولا غشاء نووى و مادتها الوراثية بتكون موجودة فى سيتوبلازم الخلية و متصلة بجدار الخلية فى نقطة و بتكون مادتها الوراثية على شكل دائرة طرفيها متصلين لكن الفطريات مادتها الوراثية بتكون منتظمة فى كروموسومات بداخل نواة حقيقية ذات غشاء بلازمى و بتكون على شكل خيوط زى المادة الوراثية للانسان
الغذاء :
انواع قليلة من البكتريا قادرة على البناء الضوئى و معظم الانواع الباقية بتكون غذائها عن طريق المواد الكيميائية لكن الفطريات بتكون اما لمتطفلة او مترممة و مش بتعمل بناء ضوئى
التكائر : البكتريا بتتكاثر بطريقتين اما عن كريق الانقسام الثنائى او عن طريق تكوين الجراثيم اما الفطريات بتتكاثر بعدة طرق منها التكاثر الخضرى ان جزء من الفطر ينمو و يكون فطر كامل او بالجرثيم اللى بتحتوى على انواع كتير منها الانواع الجنيسة و الانواع الغير جنسية [b]